Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms