Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms