Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms