Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms