Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gcn1E9PVA8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gcn1E9PVA8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gcn1E9PVA8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gcn1E9PVA8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms