Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms