Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms