Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms