Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6133B2RY53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6133B2RY53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms