Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms