Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a6B1AVK5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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