Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Arid3cA6PWV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid3cA6PWV5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms