Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll11A4Q9F4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms