Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms