Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms