Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms