Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms