Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms