Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm16A2A935 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms