Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms