Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921501E09RikA0A0R4J054 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms