Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms