Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms