Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4fQ9Z123 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms