Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms