Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn9Q9Z0S7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn9Q9Z0S7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn9Q9Z0S7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn9Q9Z0S7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn9Q9Z0S7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms