Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn3Q9Z0G9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn3Q9Z0G9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms