Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4s1Q9WVL1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms