Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn5Q9WVD4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms