Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms