Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni1Q9WUZ5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms