Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp18Q9WTV6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp18Q9WTV6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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