Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma4Q9R1P0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms