Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms