Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms