Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms