Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BcamQ9R069 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BcamQ9R069 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms