Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms