Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphs1Q9QZS7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms