Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms