Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copg1Q9QZE5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms