Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms