Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms