Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vps29Q9QZ88 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps29Q9QZ88 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms