Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt3Q9QZ47 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms