Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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