Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx4Q9QY61 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms