Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms