Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms