Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms